Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
StambpQ9CQ26 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms