Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl17Q9CPR4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl17Q9CPR4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms