Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Scd3Q99PL7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Scd3Q99PL7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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