Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lrrc4Q99PH1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lrrc4Q99PH1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms