Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trem2Q99NH8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trem2Q99NH8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms