Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atoh8Q99NA2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms