Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pramel1Q99MW3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pramel1Q99MW3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms