Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mccc1Q99MR8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mccc1Q99MR8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms