Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp1b4Q99ME6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp1b4Q99ME6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms