Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprtQ99M80 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PtprtQ99M80 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
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