Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms