Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms