Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp16Q99LG0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp16Q99LG0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms