Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gps1Q99LD4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms