Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pagr1aQ99L02 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms