Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Vmp1Q99KU0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmp1Q99KU0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms