Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PpifQ99KR7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms