Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ciao1Q99KN2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ciao1Q99KN2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms