Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab28Q99KL7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rab28Q99KL7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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