Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp11Q99K46 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp11Q99K46 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms