Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tlcd1Q99JT6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms