Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Krcc1Q99JT5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Krcc1Q99JT5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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