Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn16Q925N4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cldn16Q925N4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn16Q925N4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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