Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms