Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trpm2Q91YD4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trpm2Q91YD4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms