Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csde1Q91W50 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms