Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp3Q91W36 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp3Q91W36 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms