Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppargc1bQ8VHJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms