Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Klhdc3Q8VEM9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Klhdc3Q8VEM9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms