Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ccdc71Q8VEG0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc71Q8VEG0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc71Q8VEG0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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