Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fyco1Q8VDC1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fyco1Q8VDC1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms