Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Med17Q8VCD5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms