Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg10Q8R1P4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg10Q8R1P4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms