Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxc12Q8K5B8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms