Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot6Q8K3P5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot6Q8K3P5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms