Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brd3Q8K2F0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Brd3Q8K2F0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms