Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hacd3Q8K2C9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hacd3Q8K2C9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms