Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gtf3c1Q8K284 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c1Q8K284 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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