Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Polr1eQ8K202 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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