Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Nek9Q8K1R7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nek9Q8K1R7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nek9Q8K1R7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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