Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pnma3Q8JZW8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms