Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CopaQ8CIE6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CopaQ8CIE6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms