Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx8Q8CFD4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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