Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Klf17Q8CFA7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms