Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc38Q8CDN8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms