Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc87Q8CDL9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms