Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CcinQ8CDE2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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