Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrif1Q8CDD9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrif1Q8CDD9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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