Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E4f1Q8CCE9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms