Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8CC96 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8CC96 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CC96 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CC96 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CC96 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms